期刊論文

1. 黃明輝等人，(2016)，TAROGE射电望远镜简介，天文學進展，刊印中。

2. J. W. Nam,et al., (7/2016), Design and implementation of the TAROGE experiment, Int'l J. of Modern Physics D,

3. P. Allison, et al., for ARA collaboration, (4/25/2016) Performance of two Askaryan Radio Array stations and first results in the search for ultra-high energy neutrinos, Phys. Rev. D 93, 082003

4. 黃明輝等人，（8/2015）箱型與圓錐太陽爐的原理與製作，物理教育學刊，16(1)，23-32。

5. 黃明輝（3/2015）融入21世紀就業技能的通識教育 -- 以科學素養為例，輔仁大學全人教育學報，13, 35-56

6. Y.-Y. Chang, …M.A. Huang, …for UFFO collaboration, (1/21/2015), Inverted-conical light guide for crosstalk reduction in tightly-packed scintillator matrix and MAPMT assembly, Nucl. Inst. Meth. A, 771, 55-65, [ SCI, IF= 1.316]

7. J.E Kim, …M.A. Huang, …for UFFO collaboration, (7/24/2013),  Readout of the UFFO Slewing Mirror Telescope to detect UV/optical photons from Gamma-Ray Bursts, J. Inst., 8, P07012 ; doi:10.1088/1748-0221/8/07/P07012 [SCI, IF=1.869 ];

8. I.H. Park, …M-H A Huang, … et al, (02/20/2013), Ultra-Fast Flash Observatory for the observation of early photons from gamma-ray bursts, New J. Phys. 15, 023031 ; [SCI, IF=4.177 ];  Selected as “Highlights of 2013” by NJP

9. J.W. Nam for UFFO collaboration, (1/10/2013), The UFFO Slewing Mirror Telescope for Early Optical Observations from Gamma Ray Bursts, Modern Physics Letters A, 28, 1340003, (2013); Proc. of The first LeCosPA symposium, Taipei, Taiwan, 2/6~9/2012), pp. 274-281, "Towards Ultimate Understanding of the Universe", Ed. P. Chen, (World Sci. Pub. Singapore, 2012), ISBN: 978-981-4449-36-6 )

10. S. Jeong, for UFFO collaboration, (01/28/2013), Slewing Mirror Telescope Optics for the Early Observation of UV/optical Photons from Gamma-Ray Bursts, Optics Express, 21, 2263-2278 [SCI, Top 5% , IF 3.546];  Selected as “Spotlight on Optics for March 2013” by the Optical Society

11. Jiwoo Nam for UFFO collaboration, (01/20/2013), The UFFO slewing mirror for early optical observation o from gamma ray bursts, Modern Physic Lett. A, 28:1340003; [SCI, IF=1.083]

12. 黃明輝，(07/2012)，水瓶側孔噴柱的壓力與射程的迷思，物理教育學刊，13(1), 33-40

13. P. Allison, et al., for ARA collaboration, (2/2012), Design and Initial Performance of the Askaryan Radio Array Prototype EeV Neutrino Detector at the South Pole, Astropart. Phys., 35:457-477;  [SCI, IF=3.216]

14. M. S. Bandstra, for NCT collaboration, (9/01/2011) Detection and Imaging of the Crab Nebula with the Nuclear Compton Telescope, Astrophys. J., 738, 8;  [SCI, IF=6.024]
 
中文科普文章

1. 薛康琳、黃明輝，(2016/6)，儲能裝置新進展，物理雙月刊，38/3: 18-23

2. 黃明輝，(2016/6)，未來能源與減碳，物理雙月刊，38/3: 24-27

3. 黃明輝，(2014/12) ，台灣日照量高低的爭議，科技報導，396: 10-13，2014年12月號

4. 黃明輝，(2013/12)，能源教育的迷失概念，科技報導，384:10-12，2013年12月號

5. 黃明輝，(2013/04)，從末日流言談科學素養，科技報導，376:14-16，2013年4月號

6. 黃明輝，(2012/12)，天外飛來的輻射，科學月刊，43: 930-934

7. 黃明輝，(2012/8)，天外飛來的輻射序列活動，物理雙月刊，34: 265-268

8. 黃明輝，(2012/8)，破解2012末日預言，物理雙月刊，34: 274-282

9. 黃明輝，(2012/5)，從太陽到地面：與太空天氣有關的科與幻，臺北星空(天文館期刊)，56: 28-36

10. 黃明輝，(2012/2)，從日心到地心：與微中子有關的科與幻，臺北星空(天文館期刊)，55: 16-23

11. 黃明輝，(2011/11)，與天文有關的科與幻，臺北星空(天文館期刊)，54: 8-18

12. 黃明輝，(2011/8)，宇宙線的世紀探索，臺北星空(天文館期刊)，53: 16-22

13. 黃明輝，(2011/8)，天外飛來的輻射，臺北星空(天文館期刊)，53: 8-15

14. 黃明輝，(2011/6)，宇宙線的研究與應用，物理雙月刊，33: 271-276

15. 黃明輝，(2011/6)，台灣的宇宙線的研究，物理雙月刊，33: 277-283

專書

1. 黃明輝 （2014年03月03日）《從21世紀技能與PISA看通識教育》載於（黃明輝主編） 2013聯合大學通識教育研討會論文集（1-7）。國立聯合大學。苗栗市，奇真企業，ISBN：978-986-04-0653-5。

2. 黃明輝 (2012年08月01日) 《與天文有關的科與幻》，收錄於柯華葳 (編著)，《論情說理、說明文選》 (晨讀10分鐘序列第23冊，頁220-232)。台北市：天下雜誌公司，ISBN：978-986-241-561-0。

會議邀請演講

1. 黃明輝, “High Energy Neutrino and Cosmic-Ray Physics (高能中微子与宇宙射线物理)”, 2016 Xinjiang Summer Program on Astroparticle Physics (XApP 2016), (7/07 ~ 7/13, 2016) 中國科學院新疆天文台主辦，烏魯木齊市新疆省。(三場各80分的專題演講)

2. M.A. Huang, J. Nam , T-C Liu, C-C Chen, P. Chen, TAROGE: a prototype radio detector for Detection of UHECR and Earth skimming UHE-Nu, invited talk at the 3rd LHAASO collaboration meeting, (IHEP, Beijing, China) (Dec 9-11, 2013)

3.  M.A. Huang, Nuclear Compton Telescope: A New Compact Compton Telescope for MeV Gamma rays, The 2nd APCosPA Winter School/Workshop, (NTU, Taipei, Taiwan) (January 27, 2011).